機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經(jīng)歷轉錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化...

機體為響應各種應激，其細胞會從一種功能“狀態(tài)”轉變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”；當細胞在不同狀態(tài)之間轉變時，往往會經(jīng)歷轉錄重組，導致一些基因被沉默，一些基因被重新“喚醒”，但純化這些瞬態(tài)細胞進行研究是很困難或不可能的；scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化...

空間組測序技術，作為現(xiàn)階段單細胞技術的重要補充技術進入了組學的實驗領域以及生物信息學的分析領域。通過單細胞測序（單細胞表達尺度）+空間轉錄組測序（空間表達尺度）+數(shù)字病理（臨床診斷尺度）聯(lián)合分析可在空間和時間上描述不斷演變的組織生態(tài)系統(tǒng)，多角度深入分析組織的形...

單細胞獲得困難，不同組織要求不盡相同難以搞定？烈冰2000+項目消化經(jīng)驗，100+組織類型解離protocol，精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系，確保單細胞的獲得。凍存樣本無法實驗，珍貴樣本無法使用？烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾...

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析，越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫...

10x Genomics空間轉錄組測序技術通過將組織切片的高通量mRNA分析和形態(tài)學背景整合，使基因表達譜可以被定位回它們的原始空間位置。傳統(tǒng)的空間轉錄組測序技術局限于冰凍組織切片。10x Genomics推出全新的針對FFPE樣本的Visium空間基因表達解...

10XGenomics和Drop-Seq的技術原理。是利用十字交叉的通道，從橫向孔道中逐一輸入凝膠微珠，縱向孔道輸入細胞，凝膠微珠與細胞碰撞后會吸附在凝膠微珠上，并通過微流控技術，將之輸入到油相孔道中。這時候，就形成了一個個油滴后輸出并收集在EP管中。每一個油...

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎用戶也可以運用自如；可視化展示海量結果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI...

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎用戶也可以運用自如；可視化展示海量結果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI...

從單細胞測序描述性分析轉向復雜樣本中不同細胞類型的功能解析，越來越需要一種多組學的細胞生物學視角。通過單細胞多組學——即對不同組學的數(shù)據(jù)集進行分析和整合——科學家能夠從同一個單細胞來源中檢測多種細胞特征。這些特征包括全轉錄組基因表達、細胞表面蛋白表達、免疫組庫...

單細胞技術讓我們在基因組學、表觀基因組學、轉錄組學和蛋白質組學等層面上解析了許多錯綜復雜的生命密碼。隨著科技的進步，我們發(fā)現(xiàn)整合多個組學的信息可以更仔細地觀察細胞之間的可變性，更清楚地識別特定細胞及其功能。單細胞多組學在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重...

未來,單細胞多組學測序技術的發(fā)展,一方面將集中在對現(xiàn)有技術的優(yōu)化和新方法的開發(fā).現(xiàn)有技術的優(yōu)化不僅包括建庫手段、測序技術和算法工具等方面,還包括優(yōu)化實驗設計、自動化實驗流程以及提升實驗效率.為了更好地檢測到各種大分子的特征,研究者可以考慮從生物、化學和物理等多...

如在現(xiàn)有研究方法基礎上，進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質組學、相互作用蛋白質組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細胞蛋白質組學質譜研究方法的不斷發(fā)展，單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質的覆蓋度...

當下，單細胞測序已經(jīng)廣泛應用于多種疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件，如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發(fā)展，以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞...

單細胞測序是指針對單個細胞進行全轉錄組測序分析，可精確地描述每一個細胞的狀態(tài)，在異質性發(fā)育過程中具有不可忽視的應用價值。然而，單細胞測序無法給出固態(tài)異質化組織中細胞空間排布信息，對于揭示發(fā)育過程、病理微環(huán)境都存在很大的局限性?？臻g轉錄組測序以點陣形式記錄病理切...

針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對細胞數(shù)量、基因表達量、測序質量進行整體描述。過濾標準：由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中，并且測序中也會存在一些死細胞，導致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設定一定的標準來過濾掉假細胞或死細胞。以...

單細胞技術讓我們在基因組學、表觀基因組學、轉錄組學和蛋白質組學等層面上解析了許多錯綜復雜的生命密碼。隨著科技的進步，我們發(fā)現(xiàn)整合多個組學的信息可以更仔細地觀察細胞之間的可變性，更清楚地識別特定細胞及其功能。單細胞多組學在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重...

多樣本數(shù)據(jù)合并：FractionofReadsKept：合并樣本時，各樣本根據(jù)MappedBarcodedReadsperCell數(shù)量計算出來的數(shù)據(jù)利用率。如果各樣本間該參數(shù)值相差很大，需要進行Downsample處理，以數(shù)據(jù)量少的樣本為基準將不同樣本中細胞測...

當下，單細胞測序已經(jīng)廣泛應用于多種疾病發(fā)展過程中的關鍵過程和事件，如疾病從輕癥病變向惡性的轉化、惡性向轉移病變的發(fā)展，以及疾病對多種藥物的反應等等。單細胞測序技術作為一個需要將組織解離成為單細胞懸液，或者是采用細胞核捕獲的策略捕獲單細胞核，進而對于每一個單細胞...

烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè)，為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務，先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來，單細胞測序進入發(fā)展的快車道，烈冰作為國內首批引進單細胞實驗雙平臺的...

空間轉錄組數(shù)據(jù)可以用單細胞轉錄組數(shù)據(jù)的分析策略進行分析，例如，利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內的信號通路及其關鍵基因的較大情況，揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內發(fā)生的生物學過程。針對任何一個基因，空間轉錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間...

單細胞轉錄組測序是在單細胞水平上高通量測序分析基因表達譜的技術，突破傳統(tǒng)高通量測序的局限性，組織解離后，單個樣本一次上機能捕獲500-20000個細胞，基于每個細胞分別建庫測序，獲得單個細胞的基因結構和基因表達狀態(tài)，并鑒定細胞的類型，可以在不同樣本間從細胞類型...

隨著單細胞轉錄組測序技術（scRNA-Seq）的蓬勃發(fā)展，其在在胚胎發(fā)育，腫瘤細胞異質性，免疫細胞轉化等多方面屢建奇功，但是由于細胞形態(tài)的不同和單細胞制備中細胞敏感性的差異等因素影響，scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時可能會出現(xiàn)細胞類型占比失真，個別細胞類型丟失等...

隨著單細胞轉錄組測序技術（scRNA-Seq）的蓬勃發(fā)展，其在在胚胎發(fā)育，腫瘤細胞異質性，免疫細胞轉化等多方面屢建奇功，但是由于細胞形態(tài)的不同和單細胞制備中細胞敏感性的差異等因素影響，scRNA-Seq在數(shù)據(jù)分析時可能會出現(xiàn)細胞類型占比失真，個別細胞類型丟失等...

如在現(xiàn)有研究方法基礎上，進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質組學、相互作用蛋白質組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細胞蛋白質組學質譜研究方法的不斷發(fā)展，單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質的覆蓋度...

相對于Smart-Seq技術在細胞數(shù)量上的問題，10X平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1000-20000不等的測序細胞量，這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此，這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上，無...

對于單細胞測序而言，常常需要先構建細胞圖譜，在此基礎上再開展后續(xù)各項分析，并且數(shù)據(jù)分析時以細胞聚類（cell cluster）為討論對象，而不是像常規(guī)Bulk測序一樣以組別為分析對象，因此單細胞測序項目對樣本入組要求沒有Bulk測序那樣嚴格，但是單細胞測序，特...

單細胞測序技術（SingleCellSequencing）從一種新興的研究角度，借助已有的高通量測序手段，幫助研究者在疾病樣本的異質性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析，解決了BulkPopulationSequencing所無...

基因和基因產(chǎn)物并不是單獨運作的，而是參與了相互關聯(lián)的復雜通路、網(wǎng)絡和分子系統(tǒng)，這些合在一起實現(xiàn)了細胞、組織和生物體的運作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用，對于了解生物系統(tǒng)如何運作至關重要?！睘榱送苿涌茖W發(fā)現(xiàn)，科學家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛...

截至2022年6月，烈冰生物助力發(fā)表單細胞文章近40篇，從平臺應用比例來看，應用10X Genomics和BD Rhapsody兩大平臺發(fā)文比例各占50%左右，研究類型涵蓋疾病發(fā)展，靶點探索，免疫研究，神經(jīng)發(fā)育，干細胞分化，植物發(fā)育，退行病變，糖尿病，COVI...