烈冰生物為您的實驗定制工作流程： 對于不同用戶和實驗，單細胞實驗工作流程往往需要不同程度的樣本操作、質(zhì)量和通量。BD儀器選項可以根據(jù)具體需求進行配置。烈冰生物搭建BD FACS流式分選平臺（如 BD FACSMelody），是上游樣本富集的良好選擇。此外，我們具備BD Rhapsody單細胞成像儀提供自動化細胞計數(shù)和細胞樣本活性測試，幫助用戶制備適用于Cartridge微孔板單細胞捕獲濃度的樣本。掃描儀提供了微孔板上磁珠捕獲細胞的計數(shù)。BD Rhapsody 樣品上樣工作站輕巧便攜，可在實驗室內(nèi)輕松移動。搭配烈冰傾情研發(fā)多年的成果NovelBrain生物信息大數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)，完成測序數(shù)據(jù)的生物信息分析和結(jié)果可視化呈現(xiàn)。這些工具包括 UMI 分析算法和可視化工具，即使沒有經(jīng)驗的用戶也可分析和理解單細胞數(shù)據(jù)。助力探索生命時空多維度的動態(tài)變化的生物學(xué)信息；助力醫(yī)療健康時代！合肥scRNA單細胞測序服務(wù)公司
Single Cell Sequencing技術(shù)，即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)（NGS，Next Generation Sequencing）分析每一個單個細胞的序列信息，從而更高分辨率地揭示細胞間的細胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了，如何獲得單個細胞？如果無法獲得單個細胞這一切都是不成立的；如何獲得大批量的單個細胞？單個組織細胞群體通常在百萬級別以上，如果被檢測的測序細胞數(shù)量過小精確度不足；如何低成本地獲得大批量單個細胞？單細胞測序成本非常高，尤其是需要測2000~3000個以上的細胞的時候，如果單個細胞的分選成本也很高，技術(shù)根本無法普及。所以，正因為這些問題的存在使得高通量測序在單個細胞測序應(yīng)用中的普及度一直不足，直到幾個單細胞測序突破性技術(shù)的誕生。上海烈冰生物單細胞平臺烈冰科技成立10余年，為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù)。
單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，首先針對下機數(shù)據(jù)的質(zhì)控環(huán)節(jié)：單細胞測序產(chǎn)生數(shù)億的結(jié)果序列，不可避免的會出現(xiàn)低質(zhì)量的測序結(jié)果，存在各種情況的序列污染。因此序列過濾及質(zhì)量評估就會變得極為重要。序列質(zhì)量主要通過測序質(zhì)量值Q20/Q30的占比來表征，即堿基測序結(jié)果的錯誤率在1% / 0.1%以下的比例。理想的測序結(jié)果reads的堿基質(zhì)量均高于30。保證數(shù)據(jù)獲得后的處理結(jié)果的準(zhǔn)確性，為后續(xù)細胞類型鑒定和功能分析打下堅實基礎(chǔ)。
針對單細胞測序的細胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié)：主要是對細胞數(shù)量、基因表達量、測序質(zhì)量進行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn)：由于細胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中，并且測序中也會存在一些死細胞，導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此，我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細胞或死細胞。以10× Genomics為例，細胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點，當(dāng)存在多個斜率拐點的時候，結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細胞數(shù)量進行過濾。當(dāng)斜率拐點低于UMI=500的時候，選擇UMI=500作為細胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn)；否則，選擇和預(yù)期細胞數(shù)量接近的拐點作為細胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。
現(xiàn)有的單細胞測序技術(shù)陣營在幾個主要領(lǐng)域存在差別。一個是基于微流控通道的細胞與Beads的在通道內(nèi)的動態(tài)結(jié)合，通過油相水相不相容的特點將結(jié)合了的細胞和Beads進行分隔，在這個空間，單個細胞的內(nèi)容物釋放，轉(zhuǎn)錄本或其他生物分析物被標(biāo)記或添加索引，以便下游識別。BD Rhapsody單細胞測序平臺采用靜態(tài)微孔技術(shù)（Cyto-Seq具有類似的技術(shù)原理）。通過微孔板的物理分隔，將一個個單個細胞和帶有標(biāo)簽的磁珠，一對一的“框”在微反應(yīng)的物理平臺中。這樣，每一個細胞都會結(jié)合一個磁珠，那么在每一個磁珠中上長滿了不同的Cell Barcode和UMI Barcode連接形成的序列，再加上一端PolyT的抓手，這個抓手就會使用oligo dT抓住mRNA構(gòu)建文庫。搭配BD FACSMelody流式分選儀，全線搭建BD Rahpsody單細胞測序平臺。蘇州單細胞測序服務(wù)
自2019年起，烈冰生物BD單細胞測序平臺已助力發(fā)表近20篇一區(qū)CNS高分文章。合肥scRNA單細胞測序服務(wù)公司
對于稀有樣本，或細胞量比較少的稀有組織，樣本中每一粒細胞都很珍貴，BD Rhapsody單細胞捕獲平臺對該種類型的樣本能實現(xiàn)友好包容，如果在實際實驗中，我們發(fā)現(xiàn)因為樣本類型和制備單細胞懸液方法的不同，容易出現(xiàn)單細胞懸液中死亡細胞的比例較高的情況。也會和您探討是否考慮去除單細胞懸液中的死細胞和其他污染物的操作，以獲得高質(zhì)量數(shù)據(jù)是至關(guān)重要的。這是因為，死亡的細胞易裂解導(dǎo)致其中的RNA釋放出來。這種cell-free RNA會導(dǎo)致檢測的背景噪聲，并會影響單細胞數(shù)據(jù)的質(zhì)量。因此當(dāng)樣本活性較差時，對細胞懸液中細胞活性檢測后，需要進行一般死細胞去除的工作（一般懸液活性小于70%時考慮此操作），以保證較高的上機捕獲細胞的質(zhì)量。合肥scRNA單細胞測序服務(wù)公司
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號奇亞特中心22幢，交通便利，環(huán)境優(yōu)美，是一家服務(wù)型企業(yè)。公司致力于為客戶提供安全、質(zhì)量有保證的良好產(chǎn)品及服務(wù)，是一家有限責(zé)任公司（自然）企業(yè)。公司擁有專業(yè)的技術(shù)團隊，具有單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序等多項業(yè)務(wù)。烈冰生物將以真誠的服務(wù)、創(chuàng)新的理念、***的產(chǎn)品，為彼此贏得全新的未來！