吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2022-07-20

您的珍貴樣本,可以放心依賴(lài)烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),首先,該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù),因此不會(huì)因?yàn)闃颖炯?xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問(wèn)題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失;其次,BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無(wú)電子元件,便于攜帶,當(dāng)您的樣本需及時(shí)實(shí)驗(yàn)時(shí),我們可以“拎包上門(mén)”,快速的完成細(xì)胞捕獲部分,不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來(lái)的損失;在這,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對(duì)細(xì)胞數(shù)量包容性較好,細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul,針對(duì)樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類(lèi)型,也能完成整個(gè)項(xiàng)目的細(xì)胞捕獲工作。單細(xì)胞測(cè)序是高通量測(cè)序下的又一重大技術(shù)突破。吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

由于高通量測(cè)序?qū)嶒?yàn)方法相關(guān)的測(cè)序成本,使得單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)往往非常昂貴,烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞測(cè)序服務(wù)珍視您的每一份樣本,在平臺(tái)搭建前,我們測(cè)試評(píng)估了BD Rhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結(jié)合來(lái)看,將人293T和小鼠NIH/3T3細(xì)胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BD Rhapsody卡式芯片上。存儲(chǔ)的cDNA分子普遍擴(kuò)增并進(jìn)行低通量測(cè)序(每個(gè)細(xì)胞月8700個(gè)讀數(shù))。在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1109個(gè)細(xì)胞的上樣條件下,每個(gè)細(xì)胞中,來(lái)自每個(gè)細(xì)胞的平均99.4%的分子經(jīng)檢測(cè)為人或小鼠,這表明微孔之間的串?dāng)_非常小,在測(cè)序數(shù)據(jù)中檢測(cè)到1000個(gè)或更少細(xì)胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個(gè)細(xì)胞下小于5%。長(zhǎng)沙BD VDJ單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)服務(wù)助力探索生命時(shí)空多維度的動(dòng)態(tài)變化的生物學(xué)信息;助力醫(yī)療健康時(shí)代!

BD Rhapsody單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是利用單細(xì)胞水平上的高通量測(cè)序分析基因表達(dá)譜的技術(shù),突破傳統(tǒng)高通量測(cè)序的局限性,針對(duì)多種組織類(lèi)型的樣本,采用BD 細(xì)胞懸液制備protocol組織解離后,單個(gè)樣本一次上機(jī)能捕獲500-10000個(gè)細(xì)胞, 基于每個(gè)細(xì)胞分別建庫(kù)測(cè)序,獲得單個(gè)細(xì)胞的基因結(jié)構(gòu)和基因表達(dá)狀態(tài),并鑒定細(xì)胞的類(lèi)型,可以在不同樣本間從細(xì)胞類(lèi)型的組成和豐度角度進(jìn)行比較,反映細(xì)胞間的異質(zhì)性,提供足夠靈活的定制測(cè)定法以滿(mǎn)足多種實(shí)驗(yàn)需要,并有效縮短實(shí)驗(yàn)是時(shí)間和降低測(cè)序成本。

針對(duì)單細(xì)胞測(cè)序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對(duì)細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測(cè)序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過(guò)濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會(huì)釋放到環(huán)境或孔中,并且測(cè)序中也會(huì)存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來(lái)過(guò)濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過(guò)分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個(gè)斜率拐點(diǎn)的時(shí)候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時(shí)的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過(guò)濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時(shí)候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實(shí)的并且在基因數(shù)量上可以分析的數(shù)據(jù)。2019年,烈冰已助力發(fā)表了采用BD Rahpsody平臺(tái)的單細(xì)胞風(fēng)濕類(lèi)文章。

相對(duì)于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問(wèn)題,BD平臺(tái)普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測(cè)序細(xì)胞量,特殊研究需求的項(xiàng)目,可提供上限40000個(gè)細(xì)胞的捕獲量(單個(gè)樣本)。這個(gè)量級(jí)的測(cè)序細(xì)胞量已經(jīng)可以說(shuō)能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類(lèi)型。因此,對(duì)于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無(wú)論是從細(xì)胞數(shù)量上來(lái)說(shuō)還是表達(dá)檢測(cè)可靠性來(lái)說(shuō),都會(huì)更實(shí)用。此外針對(duì)特殊項(xiàng)目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺(tái)也有更好的捕獲效能,滿(mǎn)足您的實(shí)際需求。十二年測(cè)序經(jīng)驗(yàn),烈冰生物單細(xì)胞多組學(xué)領(lǐng)域的佼佼者。長(zhǎng)春BD VDJ單細(xì)胞測(cè)序

烈冰對(duì)于一個(gè)細(xì)胞群體中的每個(gè)細(xì)胞單獨(dú)進(jìn)行建庫(kù)測(cè)序分析。吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺(tái)的樣本類(lèi)型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺(tái)兼容。一般來(lái)說(shuō),細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來(lái)源和細(xì)胞類(lèi)型而變化。每種組織類(lèi)型都是獨(dú)特的,因此,必須在開(kāi)始任何單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗(yàn),累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈冰將盡可能提供技術(shù)及實(shí)驗(yàn)上的幫助。吉林BD VDJ單細(xì)胞平臺(tái)

上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司位于江月路999號(hào)奇亞特中心22幢,交通便利,環(huán)境優(yōu)美,是一家服務(wù)型企業(yè)。公司是一家有限責(zé)任公司(自然)企業(yè),以誠(chéng)信務(wù)實(shí)的創(chuàng)業(yè)精神、專(zhuān)業(yè)的管理團(tuán)隊(duì)、踏實(shí)的職工隊(duì)伍,努力為廣大用戶(hù)提供***的產(chǎn)品。公司擁有專(zhuān)業(yè)的技術(shù)團(tuán)隊(duì),具有單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序等多項(xiàng)業(yè)務(wù)。烈冰生物順應(yīng)時(shí)代發(fā)展和市場(chǎng)需求,通過(guò)**技術(shù),力圖保證高規(guī)格高質(zhì)量的單細(xì)胞測(cè)序,生物大數(shù)據(jù)云分析平臺(tái),空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序,單細(xì)胞多組學(xué)測(cè)序。