湖北BD單細(xì)胞測序

來源: 發(fā)布時間:2022-07-24

針對單細(xì)胞測序數(shù)據(jù)分析時的reads數(shù)、基因表達(dá)量及細(xì)胞數(shù)量判定過程中:以捕獲5000個細(xì)胞、100G的測序量為標(biāo)準(zhǔn),每個細(xì)胞的reads數(shù)大約在50k左右;每個細(xì)胞的基因中位數(shù)取決于樣本的細(xì)胞類型,例如成熟的B,T,粒細(xì)胞數(shù)量較多的組織中,由于該類型細(xì)胞表達(dá)的基因數(shù)普遍較少,導(dǎo)致基因中位數(shù)下降。而某些疾病組織、或者體外培養(yǎng)的如干細(xì)胞等,他們的基因表達(dá)數(shù)較高,甚至可以超過1W,這就導(dǎo)致該類樣本基因中位數(shù)非常高。因此,我們對細(xì)胞數(shù)量以及基因中位數(shù)確認(rèn)時,需要考察實際組織的細(xì)胞組成。搭建多種測序數(shù)據(jù)的生物信息分析平臺,5000+項目檢驗,真實可信賴。湖北BD單細(xì)胞測序

烈冰生物成立于2010年,與時俱進,堅持為科研學(xué)者提供國際前沿的高通量測序?qū)嶒灪蜕疃鹊纳镄畔?shù)據(jù)分析服務(wù),已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,在上海、北京、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場所,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營銷、運營中心。2016年起連續(xù)被評為上海市****,60+項自主知識產(chǎn)權(quán),轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測序,核測序,單細(xì)胞多組學(xué),空間轉(zhuǎn)錄組測序等多組學(xué)聯(lián)合的實驗+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺。為600+國內(nèi)高校和醫(yī)院、5000+深度合作學(xué)者用戶、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項目在醫(yī)藥開發(fā)、科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)及臨床研究,疾病分子標(biāo)志物篩選、生命和神經(jīng)發(fā)育研究等提供多層次、多組學(xué)檢測服務(wù)和解決方案,助力300+CNS國際學(xué)術(shù)期刊文章發(fā)表,30+篇單細(xì)胞技術(shù)聯(lián)合(助力)發(fā)文,IF 10+文章占比>65%。南京scRNA單細(xì)胞測序服務(wù)烈冰生物為您提供多平臺一站式全流程BD單細(xì)胞測序服務(wù)。

基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強大之處,因為它能夠了解同一單細(xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進的BD Rhapsody單細(xì)胞平臺以來,能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實驗,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系。

樣本制備后的保存 為了盡可能地減少轉(zhuǎn)錄組的變化,在對細(xì)胞進行清洗和計數(shù)后,單細(xì)胞懸液應(yīng)當(dāng)保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應(yīng)當(dāng)在3min鐘內(nèi)將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細(xì)胞的不同性質(zhì),因為這可能會影響細(xì)胞應(yīng)在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應(yīng)當(dāng)被盡快使用。例如,有些細(xì)胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風(fēng)險,而且每個團塊被當(dāng)成單細(xì)胞計數(shù),又降低了細(xì)胞計數(shù)的準(zhǔn)確性。此外,有些細(xì)胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細(xì)胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。烈冰生物為您提供一站式全流程高通量BD 單細(xì)胞測序服務(wù)。

烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。烈冰生物作為BD 中國聯(lián)合成立單細(xì)胞測序?qū)嶒炇?,為推動單?xì)胞測序技術(shù)發(fā)展貢獻中國力量。濟南single cell 單細(xì)胞測序服務(wù)公司

烈冰全線實驗平臺滿足超深度、大規(guī)模發(fā)現(xiàn)和復(fù)雜疾病研究的測序。湖北BD單細(xì)胞測序

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