轉(zhuǎn)錄組學和蛋白質(zhì)組學都是獲得基因表達情況的重要工具，從生物學角度上看，轉(zhuǎn)錄組表示了基因表達的中間狀態(tài)，可以反映諸如轉(zhuǎn)錄調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后調(diào)控的機理；而蛋白質(zhì)是生物體直接的功能執(zhí)行者，因而對其表達水平的研究有著不可替代的優(yōu)勢。要探究生物體疾病機理、脅迫機制，精確研究重要基因的表達模式和調(diào)控機理，只有聯(lián)合轉(zhuǎn)錄組學和蛋白組學表達量數(shù)據(jù)對生物樣本進行系統(tǒng)研究，才能真正觀察到mRNA-蛋白質(zhì)關聯(lián)性，進而從整體上解釋生物學問題。隨著單細胞多組學的不斷進步, 研究者將有機會在單細胞分辨率下進一步理解個體發(fā)育以及疾病發(fā)展機制。重慶BD單細胞多組學商業(yè)化服務
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè)，為科研學者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務，先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨占鰲頭。2018年以來，單細胞測序進入發(fā)展的快車道，烈冰作為國內(nèi)首批引進單細胞實驗雙平臺的公司，依托自主研發(fā)的NovelBrain®生物大數(shù)據(jù)分析平臺，為用戶提供一站式全流程的單細胞測序服務和解決方案。4年的單細胞技術(shù)的積累，烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種，皮膚、腦、胰腺、脂肪、心臟、花序等50+組織類型，100+細胞類型，1000+靶標基因，10000+樣本處理經(jīng)驗。西安烈冰單細胞多組學數(shù)據(jù)分析可視化單細胞測序技術(shù)遍地開花，烈冰服務讓您的生物醫(yī)學研究如虎添翼。
空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進行分析，例如，利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號通路及其關鍵基因的較大情況，揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學過程。針對任何一個基因，空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布；單細胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達的細胞類群；原位測序可以給出該基因在細胞內(nèi)的表達狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較，可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異，給出其在細胞內(nèi)的真實的演變狀況。
單細胞測序?qū)嶒炘贅颖炯毎蠙C分選簽，需要對細胞數(shù)量、細胞活性進行準確判斷，這對SingleCell分選標記、建庫、下機數(shù)據(jù)的質(zhì)量都具有著決定性的作用。如若細胞計數(shù)偏高，將會影響建庫的成功率；計數(shù)偏低，則會顯著提高雙細胞的比例；而細胞活率過低，就會使測序數(shù)據(jù)的利用率大打折扣，因此把好單細胞懸液質(zhì)量這一關尤為重要。而在鋪板過程中，由于不同操作人員手法具有不可避免的差異，不同的液體流速將直接影響單細胞的入孔效果。因此烈冰生物BDRhapsody單細胞分選平臺配套了專門定制的電動移液器，其具有PrimeTreat、CellLoad、BeadLoad、Wash、Lysis、Retrieval多種操作模式，來對應各種不同的操作。通過已經(jīng)設定的程序來控制液體的流速，大幅度降低人為操作習慣帶來的差異，保證實驗操作的一致性。單細胞多組學技術(shù)基于單細胞測序技術(shù)和高通量組學方法發(fā)展而來,能在單細胞分辨率下同時整合多種組學信息。
空間轉(zhuǎn)錄組測序與單細胞測序的結(jié)果不同，這里存在一個概念叫做NumberofSpotsundertissue，即，空間轉(zhuǎn)錄組片子上組織覆蓋的有效的spot位點。這個有效Spot的篩選標準是有UMI以及有序列表達。那么這個時候，貼片的質(zhì)量就成為了制約空間轉(zhuǎn)錄組有效區(qū)域的要點了。如果組織沒有很好地覆蓋到空轉(zhuǎn)片上，那么容易出現(xiàn)雖然有HE染色有組織片子，但是沒有基因表達，即無有效Spot位點。同樣的，另一個就是組織切片的大小，也就是說組織切片在整個玻片的覆蓋面積越小，分析的有效區(qū)域就越少。這兩者基本上決定了整個空間轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的基礎質(zhì)量。以單細胞轉(zhuǎn)錄組為中心的多組學聯(lián)合分析有利于更好地理解基因變化與表型變化之間的關聯(lián)性。青島BD Rhapsody單細胞多組學數(shù)據(jù)分析可視化
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空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。重慶BD單細胞多組學商業(yè)化服務
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司總部位于江月路999號奇亞特中心22幢，是一家生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準的項目，經(jīng)相關部門批準后方可開展經(jīng)營活動】的公司。烈冰生物作為醫(yī)藥健康的企業(yè)之一，為客戶提供良好的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學測序。烈冰生物致力于把技術(shù)上的創(chuàng)新展現(xiàn)成對用戶產(chǎn)品上的貼心，為用戶帶來良好體驗。烈冰生物創(chuàng)始人陳岱，始終關注客戶，創(chuàng)新科技，竭誠為客戶提供良好的服務。