烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺，可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便：單細胞瀏覽器的操作簡單，不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運行，即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運用自如；可視化展示海量結(jié)果文件：可視化展示Cluster的基因數(shù)，UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息；以及不同Cluster對應(yīng)的細胞數(shù)量、基因表達量、RNA表達量、樣本細胞分布、線粒體RNA表達量等；3D立體展示，文章動圖先人一步：單細胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進行三維立體展示，更加直觀立體的觀察細胞分布和聚類情況。烈冰引進國際主流空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺，提供保留組織內(nèi)部精細區(qū)域的空間信息的轉(zhuǎn)錄組測序。濟南空間轉(zhuǎn)錄組
細胞中基因的表達是嚴(yán)格按照時間和空間順序發(fā)生，因此細胞類型和基因表達具有時間特異性和空間特異性。時間特異性可以通過收集不同時間點的樣本進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序來分析。但是單細胞測序結(jié)果動輒上百G數(shù)據(jù)量，龐大的數(shù)據(jù)對于分析平臺和分析能力有著很高的要求，單細胞轉(zhuǎn)錄組測序（scRNA-Seq）在單細胞懸液制備的過程中破壞了細胞的空間結(jié)構(gòu)，無法給出固態(tài)異質(zhì)化組織中細胞空間排布信息。而空間轉(zhuǎn)錄組可以解決這個問題，其以點陣形式記錄組織切片細胞的空間信息。廈門烈冰空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)支持空間轉(zhuǎn)錄組測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。
作為2019年的明星技術(shù)之一，10x Genomics單細胞測序憑借其高通量、低成本、易操作、穩(wěn)定性高等優(yōu)勢一直保持著高熱度，目前利用該平臺發(fā)表的文章已達500多篇?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)優(yōu)勢：實現(xiàn)基因表達數(shù)據(jù)與空間定位信息的結(jié)合，解析多種類型組織切片樣本中基因表達譜；無需組織解離，保留組織結(jié)構(gòu)及細胞微環(huán)境，鑒定異質(zhì)性組織中細胞類型，避免相關(guān)偏好性；可用于挖掘新的組織生物標(biāo)記物；可與現(xiàn)行實驗室組織分析方法輕松對接，短時間內(nèi)即可完成切片及文庫制備流程。
當(dāng)組織冷凍切片附在帶有spatialbarcode的空間轉(zhuǎn)錄組芯片上時，通過透化處理，細胞內(nèi)的mRNA釋放出來，從而被芯片上帶有oligo-dT的探針捕獲。被捕獲的mRNA開始逆轉(zhuǎn)錄，得到的cDNA中包含了spatialbarcode序列。通過上機測序，可以將每個mRNA轉(zhuǎn)錄的序列映射回組織切片中的映射回組織切片中的原始位置。Visium空間轉(zhuǎn)錄組的重點在于芯片部分：正式文庫構(gòu)建的芯片上有4個捕獲區(qū)域（6.5mmX6.5mm，可以檢測4個樣本）每個捕獲區(qū)域含有約5000個被條形碼標(biāo)記的點（barcodedspots）每個spot直徑55μm，每個spot能捕獲1-10個細胞spot與spot中心點之間的距離為100μm每個spot含有上百萬個可以與mRNA結(jié)合的捕獲探針，每個探針上都帶有獨特的spatialbarcodes，用以標(biāo)記捕獲的mRNA的空間位置。全線搭建10x Genomics空間轉(zhuǎn)錄組測序平臺。
空間轉(zhuǎn)錄組測序是在組織原位檢測全轉(zhuǎn)錄組基因表達的?種技術(shù)，可以展?組織切?中不同區(qū)域的基因表達情況，同時能夠得到?的基因在組織內(nèi)部的空間位置信息。與傳統(tǒng)的全基因轉(zhuǎn)錄組或單細胞轉(zhuǎn)錄組測序相?，空間轉(zhuǎn)錄組測序漿病理影像（H&E染?）與測序數(shù)據(jù)映射在?起，進?可以分析組織切內(nèi)部空間結(jié)構(gòu)的細胞異質(zhì)性。常規(guī)單細胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)丟失了細胞在原組織中至關(guān)重要的空間位置信息，而單細胞空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)在進行單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的同時保留并記錄了細胞的空間位置信息?？臻g轉(zhuǎn)錄組技術(shù)能夠揭示細胞間的相互作用以及細胞所處的微環(huán)境，將成為發(fā)育生物學(xué)、神經(jīng)生物學(xué)、免疫生物學(xué)等領(lǐng)域的研究利器?；驕y序相關(guān)產(chǎn)品和技術(shù)已由實驗室研究逐漸演變到臨床應(yīng)用，是下一個改變世界的技術(shù)。西安烈冰生物空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)公司
烈冰生物成立于2010年，專注于空間轉(zhuǎn)錄組測序領(lǐng)域科研服務(wù)。濟南空間轉(zhuǎn)錄組
空間轉(zhuǎn)錄組測序的數(shù)據(jù)分析基本分為三個階段：1.數(shù)據(jù)的預(yù)處理部分；2.Spot點陣的分群與定義；3.Spot分群的功能與生物學(xué)價值。每一個部分都不可或缺，其結(jié)果都對后續(xù)的分析結(jié)果有重要影響。由于空間轉(zhuǎn)錄組的序列結(jié)構(gòu)與單細胞轉(zhuǎn)錄組測序的左端序列結(jié)構(gòu)是非常接近的，都是Cellbarcode/SpotBarcode+UMI+捕獲區(qū)域這樣的設(shè)計。右端普遍為捕獲的RNA序列。因此采用單細胞的原始數(shù)據(jù)過濾策略即可，左端可以考慮切下捕獲區(qū)域前的序列區(qū)域作為后續(xù)分析用的序列以減少分析負荷。隨后，采用10X官方的Spatialranger的策略進行后續(xù)分析，解析出位于空間位置中的有效的Spot表達矩陣。濟南空間轉(zhuǎn)錄組
上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司擁有生物科技、醫(yī)藥科技、信息科技、計算機科技領(lǐng)域內(nèi)的技術(shù)開發(fā)、技術(shù)服務(wù)、技術(shù)轉(zhuǎn)讓、技術(shù)咨詢，市場營銷策劃，市場信息咨詢與調(diào)查（不得從事社會調(diào)查、社會調(diào)研、民意調(diào)查、民意測驗），從事貨物及技術(shù)的進出口業(yè)務(wù)，計算機、軟件及耗材（除?？兀?，軟件開發(fā)【依法須經(jīng)批準(zhǔn)的項目，經(jīng)相關(guān)部門批準(zhǔn)后方可開展經(jīng)營活動】等多項業(yè)務(wù)，主營業(yè)務(wù)涵蓋單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序。公司目前擁有較多的高技術(shù)人才，以不斷增強企業(yè)重點競爭力，加快企業(yè)技術(shù)創(chuàng)新，實現(xiàn)穩(wěn)健生產(chǎn)經(jīng)營。上海烈冰生物醫(yī)藥科技有限公司主營業(yè)務(wù)涵蓋單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序，堅持“質(zhì)量保證、良好服務(wù)、顧客滿意”的質(zhì)量方針，贏得廣大客戶的支持和信賴。公司憑著雄厚的技術(shù)力量、飽滿的工作態(tài)度、扎實的工作作風(fēng)、良好的職業(yè)道德，樹立了良好的單細胞測序，生物大數(shù)據(jù)云分析平臺，空間轉(zhuǎn)錄組測序，單細胞多組學(xué)測序形象，贏得了社會各界的信任和認可。