廣州scRNA單細胞多組學

來源: 發(fā)布時間:2022-08-18

分子檢測型單細胞多組學測序技術中也有一些集中于探究單細胞內(nèi)表觀遺傳組各層面的變化及關聯(lián)。功能研究型單細胞多組學測序技術,結合了強大的CRISPR基因編輯技術,從而可以深度挖掘基因表達調(diào)控與細胞功能以及命運決定之間的因果關系。在未來,為了更系統(tǒng)地研究多層組學之間的互動關系對細胞命運的影響,一方面,單細胞多組學測序技術的策略會繼續(xù)向轉(zhuǎn)錄組結合其他多個組學的三組學甚至四組學方向發(fā)展.另一方面,單細胞多組學測序技術會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學測序分析和功能驗證同時進行的方法,這種探究因果關系的策略對于揭示發(fā)育和疾病發(fā)展中的關鍵因子和分子網(wǎng)絡模塊十分重要。隨著單細胞多組學的不斷進步, 研究者將有機會在單細胞分辨率下進一步理解個體發(fā)育以及疾病發(fā)展機制。廣州scRNA單細胞多組學

細胞是構成生命的基礎單元,迅速發(fā)展的單細胞測序技術為在單細胞層面研究細胞功能及其背后的基因調(diào)控機制提供了重要的技術手段,單細胞測序可用于檢測多種不同的組學種類,包括轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)開放組、DNA甲基化組、組蛋白修飾組等等,對不同組學技術產(chǎn)生的數(shù)據(jù)進行整合分析有助于更地刻畫細胞內(nèi)的基因調(diào)控狀態(tài)、揭示調(diào)控機制。然而,與傳統(tǒng)的bulk數(shù)據(jù)相比,單細胞數(shù)據(jù)具有規(guī)模大、噪聲高、異構性強等特點,如何通過開發(fā)新的計算方法實現(xiàn)對這些寶貴數(shù)據(jù)的有效利用已成為當今生物信息學領域關注的重點與熱點。重慶高通量測序單細胞多組學測序烈冰智造PanoCell單細胞捕獲,媲美國際主流的單細胞平臺。

空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)可以用單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的分析策略進行分析,例如,利用GO和Pathway分析篩選不同發(fā)育時期特定空間區(qū)域內(nèi)的信號通路及其關鍵基因的較大情況,揭示在特定發(fā)育時期特定區(qū)域內(nèi)發(fā)生的生物學過程。針對任何一個基因,空間轉(zhuǎn)錄組可以顯示表達該基因的點陣及其空間排布;單細胞轉(zhuǎn)錄組可以給出該基因表達的細胞類群;原位測序可以給出該基因在細胞內(nèi)的表達狀況。通過不同發(fā)育時間點的信息比較,可以分析細胞類群在某個部位在不同時間點的差異,給出其在細胞內(nèi)的真實的演變狀況。

2016年發(fā)表的DR-seq和G&T-seq技術,實現(xiàn)在單細胞內(nèi)同時進行基因組和轉(zhuǎn)錄組的測序分析,使得研究人員能夠在分析細胞間基因組差異和基因表達異質(zhì)性的同時,進一步理解基因組序列差異、拷貝數(shù)變異與轉(zhuǎn)錄組異質(zhì)性之間的關系.隨后在同一個單細胞內(nèi),基于轉(zhuǎn)錄組、染色質(zhì)可及性、染色質(zhì)構象、DNA拷貝數(shù)、DNA甲基化、蛋白質(zhì)豐度或者空間狀態(tài)等整合分析的多組學方法也相繼出現(xiàn)。相較于利用不同的單細胞單組學測序方法從一類細胞中分別獲取轉(zhuǎn)錄組、基因組、表觀遺傳組等進行分析,單細胞多組學測序技術可以從同一個單細胞中同時獲取多種組學數(shù)據(jù),可以更好地反映細胞在特定狀態(tài)下各組學間的關聯(lián)以及復雜的分子調(diào)控網(wǎng)絡。烈冰測序數(shù)據(jù)分析平臺,不依賴已有物種信息,可研究非模式物種,針對不同平臺的數(shù)據(jù),制定多套流程。

相對于Smart-Seq技術在細胞數(shù)量上的問題,BD和10X這兩個平臺普遍提供的細胞數(shù)量都在1-6K不等的測序細胞量,這個量級的測序細胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的SingleCell群體類型。因此,這兩種技術對于基于基因表達進行準確細胞分型上,無論是從細胞數(shù)量上來說還是表達檢測可靠性來說,都會更實用。同時依托RandomCellLabel技術,使得其對于NovaSeq、HiSeqXTen、Hiseq4000等設備存在的Indexhooping現(xiàn)象,相對于Smart-Seq數(shù)據(jù)來說,影響幾乎可以忽略不計(10XGenomics官方網(wǎng)站曾給出hooping測試結果,顯示無影響。烈冰生物為您提供一站式全流程單細胞測序服務。合肥single cell 單細胞多組學數(shù)據(jù)分析

單細胞多組學 測序技術會轉(zhuǎn)向研發(fā)多組學測序分析和功能驗證同時 進行的方法。廣州scRNA單細胞多組學

單細胞測序技術(SingleCellSequencing)從一種新興的研究角度,借助已有的高通量測序手段,幫助研究者在疾病樣本的異質(zhì)性、樣本微環(huán)境、發(fā)育學、免疫學以及其他領域中進行單細胞層面的數(shù)據(jù)解析,解決了BulkPopulationSequencing所無法解決的問題。這樣一個新的研究領域必然也需要足夠可靠的實驗手段來支撐。BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng)為此提供了完善的硬件設備,保證了從單細胞懸液質(zhì)量評估到單細胞分選標記過程中每一個實驗步驟的完善質(zhì)控。NovelBio單細胞實驗團隊借助BDRhapsody單細胞分選系統(tǒng),在實驗實施層面對單細胞測序結果的可靠性提供了強有力的保證。繼單細胞懸液制備之后,又在另一道關鍵關卡提供了可靠的支持,幫助研究者在單細胞測序領域收獲更多的成果。廣州scRNA單細胞多組學

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