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烈冰生信團隊傾情研發(fā)的NovelBrain®生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細胞測序數(shù)據(jù),能夠實現(xiàn)細胞類型鑒定的快、精、準:一鍵導入genelist構建個性化基因列表;輕松一點即可展示Marker基因的Featureplot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調用和一站式全流程自動化分析,節(jié)省工作時間并提升整體工作效率。江蘇BD單細胞多組學測序烈冰生物作為BD 中國聯(lián)合成立單細胞測序實驗室,為推動單細胞測序技術發(fā)展貢獻中國力量。
如在現(xiàn)有研究方法基礎上,進行特定亞細胞區(qū)域的蛋白質組學、相互作用蛋白質組學以及某種特定翻譯后修飾類型的蛋白質組學的研究等。這將有助于諸多生化過程以及致病機理的全新認識與發(fā)現(xiàn)。隨著基于單細胞蛋白質組學質譜研究方法的不斷發(fā)展,單細胞分析方法的靈敏度、蛋白質的覆蓋度、細胞通量、空間分辨率以及多組學的兼容能力會不斷突破我們的認知極限。更重要的是,單細胞分析在臨床診斷、疾病分型以及細胞發(fā)展機制這些重大生命科學領域方面的應用將會越來越大。
樣本制備后的保存為了盡可能地減少轉錄組的變化,在對細胞進行清洗和計數(shù)后,單細胞懸液應當保存于冰上,直至用于后續(xù)的上機和文庫制備步驟。在理想狀況下,一旦制備好樣本,應當在3min鐘內將其用于下游步驟。然而,您還有必要了解各類細胞的不同性質,因為這可能會影響細胞應在冰上保存的時間,以及它們在制備后多久便應當被盡快使用。例如,有些細胞(如PBMC)如果在冰上放置一段時間,它們就開始形成團塊。這些團塊很難解離,增加了堵塞的風險,而且每個團塊被當成單細胞計數(shù),又降低了細胞計數(shù)的準確性。此外,有些細胞更加粘稠,形成團塊的速度更快。對于這些細胞,必須盡量減少制備和使用之間的時間差。單細胞測序技術提供了單個細胞水平下的科學研究視角。
由于高通量測序實驗方法相關的測序成本,使得單細胞實驗往往非常昂貴,烈冰生物BDRhapsody單細胞測序服務珍視您的每一份樣本,在平臺搭建前,我們測試評估了BDRhapsody的性能,與BD官方公布的數(shù)據(jù)結合來看,將人293T和小鼠NIH/3T3細胞的1:1混合物以不同濃度上樣到BDRhapsody卡式芯片上。存儲的cDNA分子普遍擴增并進行低通量測序(每個細胞月8700個讀數(shù))。在測序數(shù)據(jù)中檢測到1109個細胞的上樣條件下,每個細胞中,來自每個細胞的平均99.4%的分子經檢測為人或小鼠,這表明微孔之間的串擾非常小,在測序數(shù)據(jù)中檢測到1000個或更少細胞的上樣密度下,多重態(tài)發(fā)生率接近零,并且在15000個細胞下小于5%。深度的單細胞測序數(shù)據(jù)解讀助力醫(yī)療健康大時代。北京BD Rhapsody單細胞測序服務公司
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單細胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定?烈冰2000+項目消化經驗,100+組織類型解離protocol,精心設計不同組織實驗的解離、細胞懸浮實驗體系,確保單細胞的獲得。凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用?烈冰采用國際認可的凍存組織復蘇技術以及死細胞過濾技術,確保凍存組織使用。珍貴樣本,細胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細胞?采用國際認可的10XGenomics,BDRhapsody雙平臺模式,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細胞量少,背景雜也能做單細胞。單細胞RNA分類精度不足,部分細胞無法細分?烈冰同時采用單細胞蛋白質組與單細胞轉錄組測序技術,真正做到從上游到下游的全流程檢測,確保超高的細胞分類精度。無錫BD VDJ單細胞實驗服務
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