采用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學技術對三個脫水特殊階段（21、27和40DAP）的新鮮蓮種胎進行了蛋白質(zhì)組學分析，共鑒定了5,477個蛋白質(zhì)。對測試樣本進行了PCA分析，結果顯示，不同組間樣品具有很好的區(qū)分，每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70％以上（圖2A）。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中，198個（32%）和198個（26%）蛋白質(zhì)豐度增加，而420個（68%）和558個（74%）蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降（圖2B）。只有30個蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化（圖2C）。蛋白組學研究必看的經(jīng)典綜述。北京蛋白組學領域
綜上所述，本研究應用RNA-seq轉(zhuǎn)錄組分析結合iTRAQ蛋白質(zhì)組學技術，探討油茶種子不同成熟期儲量積累的動態(tài)變化。此外，作者還探討了黃酮類化合物和脂肪酸的生物合成和代謝可能的調(diào)控機制。許多功能轉(zhuǎn)錄本(16530)和蛋白質(zhì)物種(1228)的模式發(fā)生了***變化，其中317個DAPs被轉(zhuǎn)錄組結果覆蓋。結合結構基因(蛋白)或轉(zhuǎn)錄因子的表達譜及相應化合物的含量，對重要代謝產(chǎn)物的調(diào)控網(wǎng)絡進行了探討。結果表明，黃酮類化合物的合成能力在種子成熟過程中逐漸減弱，而脂肪酸的合成能力則先升高后下降。內(nèi)蒙古tmt標記定量蛋白組學一文了解DIA、TMT/iTRAQ、傳統(tǒng)Label free蛋白組學區(qū)別在哪。
定量蛋白質(zhì)組學研究：2022年2月，上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所鮑大鵬研究員課題組在《FrontiersinMicrobiology》期刊發(fā)表的題為“OxidativeStressandAutophagyAreImportantProcessesinPostRipenessandBrownFilmFormationinMyceliumofLentinulaedodes”的研究成果，通過iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學等技術對香菇菌絲進行定量蛋白質(zhì)組學和代謝組學分析，發(fā)現(xiàn)氧化應激和自噬是香菇菌絲后熟轉(zhuǎn)色重要過程，并對其在蛋白質(zhì)組和代謝組水平上的分子機制有了新的認識。涉及的歐易/鹿明生物服務產(chǎn)品：iTRAQ標記定量蛋白組學、GC-MS非靶向代謝組學
為了確定TMT AD蛋白網(wǎng)絡模塊是否也存在于其他的隊列和大腦區(qū)域，使用 TMT標記定量蛋白質(zhì)組學多個隊列的所有組織，為每個隊列生成蛋白質(zhì)共表達網(wǎng)絡，并評估了 AD 網(wǎng)絡模塊是否保留在每個隊列和大腦區(qū)域中。發(fā)現(xiàn)幾乎所有的 TMT AD 網(wǎng)絡模塊都保留在隊列和大腦區(qū)域（圖2b）。阿爾茨海默病(AD)是一種神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病，其病因至今尚不清楚。本文從蛋白組學方向出發(fā)，建立蛋白共表達網(wǎng)絡，綜合轉(zhuǎn)錄組學結果，解析疾病相關的蛋白組學模塊或能為AD提供可靠的生物標志物，并為治療帶來希望。蛋白質(zhì)組與代謝組聯(lián)合分析。
通過蛋白質(zhì)組學+轉(zhuǎn)錄組學研究方法，發(fā)現(xiàn)大黃素引發(fā)外泌體通過抑制代謝通路來減少肺泡巨噬細胞的活化和改善肺部炎癥的特征，探究了外泌體在參與炎癥相關***損傷中的重要作用，為大黃素可以通過減少胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化來減輕嚴重急性胰腺炎相關的急性肺損傷提供依據(jù)。中文標題：大黃素通過抑制胰腺外泌體介導的肺泡巨噬細胞活化減輕嚴重急性胰腺炎相關的急性肺損傷研究對象：大鼠血漿外泌體發(fā)表期刊：ActaPharmaceuticaSinicaB影響因子：11.413發(fā)表時間：2021年10月合作單位：四川大學華西醫(yī)院運用生物技術：TMT標記定量蛋白組學（由歐易/鹿明生物提供技術支持）、轉(zhuǎn)錄組學一站式服務,蛋白組學研究不同生物體在不同時刻/狀態(tài)下蛋白質(zhì)表達的變化。安徽蛋白組學測序上海
蛋白質(zhì)組學,Label Free/iTRAQ/dia/MRM/PRM。北京蛋白組學領域
本文為中國科學院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章，通過iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應。海洋酸化可能增加海洋軟體動物疾病加劇的風險。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟和生態(tài)影響，因此本研究結果具有重要的指導意義。在本研究中，研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水（約2000ppm）中28天，然后用金氏弧菌進行***處理，以此研究海洋酸化是否會影響牡蠣對病原菌***的免疫反應。此外，利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學方法，對牡蠣鰓這一潛在的造血部位進行了研究，以分析對OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過程。北京蛋白組學領域
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