上海定量蛋白組學

來源: 發(fā)布時間:2022-09-20

通過磷酸化蛋白質(zhì)組定量鑒定了1244個磷酸化蛋白質(zhì),其中474個(38%)在**組織中***增加,183個(15%)***下降。三種蛋白亞型中磷酸化蛋白組學的比較結果揭示了亞型特異性的活性激酶。進一步對差異改變的磷酸化位點的研究顯示,在S-I中觀察到參與黏附的底物升高和參與RNA轉(zhuǎn)運的底物減少。而基于timsTOF Pro離子淌度4D蛋白質(zhì)組技術,是對蛋白組學+磷酸化組學的雙重升級,可實現(xiàn)快速采集、更高的靈敏度和特異性,**臨床蛋白質(zhì)組學在定性數(shù)量更多、定量更準確、位點鑒定更精確、樣本需求量更低、檢測周期更短等性能上***提升,從蛋白質(zhì)表達和修飾雙重角度更好地發(fā)揮發(fā)掘分子調(diào)控機制、發(fā)現(xiàn)疾病分子分型以及發(fā)掘生物標志物等多重作用。蛋白組學技術對腎錯構瘤尿液差異蛋白的研究。上海定量蛋白組學

iTRAQ蛋白質(zhì)組學研究實用案例:2021年8月,浙江大學藥學院何俏軍、羅沛華團隊在Autophagy期刊發(fā)表了題為“Autophagic degradation of CCN2 (cellular communication network factor 2) causes cardiotoxicity of sunitinib”的研究成果,通過動物模型、功能實驗、iTRAQ蛋白質(zhì)組學等研究方法,發(fā)現(xiàn)了舒尼替尼誘導的自噬導致心肌細胞凋亡和心臟功能障礙,探究了舒尼替尼誘導的適應不良自噬通過TOLLIP介導的內(nèi)體相關通路選擇性降解心肌細胞存活介質(zhì)CCN2的機理,揭示了調(diào)節(jié)心肌細胞死亡的自噬降解新靶標蛋白。為提高基于舒尼替尼的*****安全性提供了方法及理論依據(jù)。中文標題:CCN2的自噬降解導致舒尼替尼的心臟毒性研究對象:小鼠發(fā)表期刊:Autophagy影響因子:16.016發(fā)表時間:2021年8月合作單位:浙江大學藥學院運用生物技術:iTRAQ蛋白質(zhì)組學(由鹿明生物提供技術支持)天津蛋白組學 微生物蛋白組學,研究方法,高通量定性定量研究,有。

3篇經(jīng)典的蛋白組學和代謝組學在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎和技術支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學、代謝組學在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標題:CO2誘導的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細胞和蛋白質(zhì)組學的綜合研究研究對象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國科學院海岸帶研究所運用歐易/鹿明生物技術:iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學(由鹿明生物提供技術支持)

在本研究中,利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質(zhì)組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,在種子發(fā)育過程中,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當大的時序一致性。在四個發(fā)育時期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關鍵時期:在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值,同時種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡,乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。歐易生物鹿明生物蛋白組學聯(lián)合分析。

本文為中國科學院海岸帶研究所趙建民課題組在ScienceoftheTotalEnvironment期刊發(fā)表了的文章,通過iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學研究弧菌***加劇了海洋酸化造成的牡蠣免疫抑制效應。海洋酸化可能增加海洋軟體動物疾病加劇的風險。從而將產(chǎn)生重大的經(jīng)濟和生態(tài)影響,因此本研究結果具有重要的指導意義。在本研究中,研究者將太平洋牡蠣暴露于酸化海水(約2000ppm)中28天,然后用金氏弧菌進行***處理,以此研究海洋酸化是否會影響牡蠣對病原菌***的免疫反應。此外,利用基于iTRAQ的定量蛋白質(zhì)組學方法,對牡蠣鰓這一潛在的造血部位進行了研究,以分析對OA和金氏弧菌共同作用較敏感的生理過程。蛋白質(zhì)組學基本策略 研究基礎 研究內(nèi)容 研究意義背景。天津蛋白組學測試價格

單細胞蛋白組學之質(zhì)譜流式細胞技術。上海定量蛋白組學

采用TMT標記定量蛋白質(zhì)組學技術對三個脫水特殊階段(21、27和40DAP)的新鮮蓮種胎進行了蛋白質(zhì)組學分析,共鑒定了5,477個蛋白質(zhì)。對測試樣本進行了PCA分析,結果顯示,不同組間樣品具有很好的區(qū)分,每組的三個重復樣本被聚集在一起。PCA的前兩個成分占總方差的70%以上(圖2A)。三個試驗組之間共有815個差異表達蛋白。其中,198個(32%)和198個(26%)蛋白質(zhì)豐度增加,而420個(68%)和558個(74%)蛋白質(zhì)豐度在27DAP和40DAP組分別下降(圖2B)。只有30個蛋白質(zhì)的豐度在27DAP和40DAP組之間具有***變化(圖2C)。上海定量蛋白組學

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