為了確定探針是否與相應(yīng)的基因組DNA雜交,有必要對探針加以標記,以便在結(jié)合部位獲得可識別的信號,通常采用放射性同位素32P標記探針的某種核苷酸α磷酸基。但近年來已發(fā)展了一些用非同位素如生物素-親合素系統(tǒng)、地高辛配體等作為標記物的方法。非同位素標記的優(yōu)點是保存時間較長,而且避免了同位素的污染。**常用的探針標記法是缺口平移法(nick translation)。首先用適當濃度的DNA酶Ⅰ(DNAseⅠ)在探針DNA雙鏈上造成缺口,然后再借助于DNA聚合酶Ⅰ(DNa poly merasⅠ)的5’→3’的外切酶活性,切去帶有5’磷酸的核苷酸;同時又利用該酶的5’→3’聚酶活性,使32P標記的互補核苷酸補入缺口,DNA聚合酶Ⅰ的這兩種活性的交替作用,使缺口不斷向3’的方向移動,同時DNA鏈上的核苷酸不斷為32P標記的核苷酸所取代。分析對象是固體物質(zhì)表面細小顆粒或微小區(qū)域,小范圍直徑為1μm。閔行區(qū)質(zhì)量探針推薦貨源
DNA探針根據(jù)其來源分為3種:一種來源于基因組中的基因本身,稱為基因組探針(genomic probe),可以是基因的全序列,或者基因上的一段序列;另一種是從相應(yīng)的基因經(jīng)轉(zhuǎn)錄獲得mRNA,再通過逆轉(zhuǎn)錄得到的探針,稱為cDNA探針(cDNA probe);此外,還可在體外人工合成20~50個堿基的與基因序列互補的DNA片段,稱為寡核苷酸探針。 [1]基因組DNA探針的獲得有賴于分子克隆技術(shù)的發(fā)展和應(yīng)用。要得到一種特異性DNA探針,常常是比較煩瑣的。以細菌為例,細菌的基因組大小約為5×106堿基,約含3000個基因。要獲得某細菌特異的核酸探針,通常要采取建立細菌基因組DNA文庫的辦法,即將細菌DNA切成小片段后(如用限制性內(nèi)切酶做不完全水解)分別克隆得到包含基因組的全信息的克隆庫,然后用多種其他菌種的DNA探針來篩選,產(chǎn)生雜交信號的克隆被剔除,***剩下的不與任何其他細菌雜交的克隆則可能含有該細菌特異性DNA片段。上海優(yōu)勢探針五星服務(wù)近年形成了掃描電鏡-顯微分析儀的聯(lián)合裝置,可在觀察微區(qū)形貌的同時逐點分析試樣的化學(xué)成分及結(jié)構(gòu)。
血凝素與生物素有非常高的親和性,當血凝素標記上過氧化物酶或堿性磷酸酶,經(jīng)雜交反應(yīng)**終形成探針-生物素-血凝素酶復(fù)合物(ABC法),酶催化底物顯色,觀察結(jié)果。ABC法底物顯色生成不溶物,以便觀測結(jié)果。酶標記法復(fù)雜、重復(fù)性差,成本高,但便于運輸、保存,靈敏度與放射物標記法相當。探針標記方法①缺口平移標記法。利用的是DNA聚合酶I能修復(fù)DNA鏈的功能。該法先由DNaseI在DNA雙鏈上隨機切出切口,然后DNA聚合酶I沿缺口水解5´端核苷酸,同時在3´端修復(fù)加入被標記核苷酸,切口平行推移。缺口平移法快速、簡便、成本相對較低、比活性相對較高、標記均勻,多用于大分子DNA標記,(>1000bp比較好),但單鏈DNA、RNA不能用該法標記。
值得一提的是,通過改變外源基因的插入方向或選用不同的RNA聚合酶,可以控制RNA的轉(zhuǎn)錄方向,即以哪條DNA鏈以模板轉(zhuǎn)錄RNA。這種可以得到同義RNA探針(與mRNA同序列)和反義RNA探針(與mRNA互補),反義RNA又稱cRNA,除可用于反義核酸研究外,還可用于檢測mRNA的表達水平。在這種情況下,因為探針和靶序列均為單鏈,所以雜交的效率要比DNA-DNA雜交高幾個數(shù)量級。RNA探針除可用于檢測DNA和mRNA外,還有一個重要用途,在研究基因表達時,常常需要觀察該基因的轉(zhuǎn)錄狀況。電子探針的構(gòu)成除了與掃描電鏡結(jié)構(gòu)相似的主機系統(tǒng)以外,還主要包括分光系統(tǒng)、檢測系統(tǒng)等部分。
用此探針在DNA文庫中篩選,陽性克隆即是目標蛋白的編碼基因。值得一提的是真核細胞和原核細胞DNA組織有所不同。真核基因中含有非編碼的內(nèi)含子序列,而原核則沒有。因此,真核基因組DNA探針用于檢測基因表達時雜交效率要明顯低于cDNA探針。DNA探針(包括cDNA探針)的主要優(yōu)點有下面三點:①這類探針多克隆在質(zhì)粒載體中,可以無限繁殖,取之不盡,制備方法簡便。②DNA探針不易降解(相對RNA而言),一般能有效抑制DNA酶活性。③DNA探針的標記方法較成熟,有多種方法可供選擇,如缺口平移,隨機引物法,PCR標記法等,能用于同位素和非同位素標記。電子探針可以對試樣中微小區(qū)域(微米級)的化學(xué)組成進行定性或定量分析。上海優(yōu)勢探針五星服務(wù)
電子束轟擊樣品表面將產(chǎn)生特征X射線,不同的元素有不同的X射線特征波長和能量。閔行區(qū)質(zhì)量探針推薦貨源
③末端標記法(又叫尾標)。利用末端轉(zhuǎn)移酶可進行“尾標”,尾標適用于寡核苷酸探針標記,寡核苷酸探針多用于核酸“點”突變的檢測,該探針可用核酸合成儀人工合成,克隆出的探針一般較長,特異性好,標記量大,雜交的檢出信號強。探針合成的注意事項①合成探針的長短,一般在20~50個核苷酸之間。合成過長成本高,且易出現(xiàn)聚合酶合成錯誤,雜交時間長,合成太短則特異性下降。②堿基組成G-C應(yīng)含40%~60%,一種堿基連續(xù)重復(fù)不超過4個,以免非特異性雜交產(chǎn)生。③探針自身序列內(nèi)應(yīng)無互補區(qū)域,以免產(chǎn)生“發(fā)夾”結(jié)構(gòu),影響雜交。總之,一個好的探針**終要在實踐中才能加以確認。閔行區(qū)質(zhì)量探針推薦貨源
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