單細(xì)胞測序方法不但改進(jìn)了實驗過程,還幫助科學(xué)家在健康和疾病研究的關(guān)鍵領(lǐng)域取得新進(jìn)展。那些過去從轉(zhuǎn)錄平均值或單項參數(shù)讀取中無法獲得的新發(fā)現(xiàn)正在改變我們對傳染病、神經(jīng)退行性疾病等疾病的認(rèn)識。從鑒定新的細(xì)胞類型和狀態(tài),到揭開疾病用藥應(yīng)答和耐藥的潛在機(jī)制,單細(xì)胞測序正在推動突破性的研究,有望改變生物學(xué)和醫(yī)療。無論是無法解釋的疾病,還是人體或自然界中尚未探索的系統(tǒng),曾經(jīng)模糊的東西正變得越來越清晰。隨著我們邁向科學(xué)的未來,我們手頭的工具就像伽利略的望遠(yuǎn)鏡一樣能夠提高焦距和放大倍數(shù),而定義科學(xué)未來的知識新深度是十年前的人們所無法想象的。ATCG堿基的排列組合構(gòu)成了測序的龐大世界。BD單細(xì)胞多組學(xué)測序烈冰生物...
單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。2019年,烈冰已助力發(fā)表了采用BD ...
單細(xì)胞獲得困難,不同組織要求不盡相同難以搞定? 烈冰2000+項目消化經(jīng)驗,100+組織類型解離protocol,精心設(shè)計不同組織實驗的解離、細(xì)胞懸浮實驗體系,確保單細(xì)胞的獲得。 凍存樣本無法實驗,珍貴樣本無法使用? 烈冰采用國際認(rèn)可的凍存組織復(fù)蘇技術(shù)以及死細(xì)胞過濾技術(shù),確保凍存組織使用。 珍貴樣本,細(xì)胞數(shù)量太少,消化背景雜無法做單細(xì)胞? 采用國際認(rèn)可的10X Genomics,BD Rhapsody雙平臺模式,根據(jù)樣本實際情況和用戶需求提供客觀有效的實驗方案,細(xì)胞量少,背景雜也能做單細(xì)胞。 單細(xì)胞RNA分類精度不足,部分細(xì)胞無法細(xì)分? 烈冰同時采用單細(xì)胞蛋白質(zhì)組與單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù),真正做...
烈冰與國內(nèi)高校、研究所、醫(yī)院和藥企單位開展深度合作,服務(wù)于600+臨床與研究機(jī)構(gòu),1000+客戶和5000+重要科研項目,助力并聯(lián)合發(fā)表300+篇CNS等國際學(xué)術(shù)期刊(不完全統(tǒng)計),在單細(xì)胞領(lǐng)域,烈冰助力用戶發(fā)表單細(xì)胞文獻(xiàn)30+篇,總IF>300+,IF>10+以上文章占比65%以上,包含Immunity、Nature Cell Biology、Nature Plants 、Advanced Science等生物領(lǐng)域國際主流學(xué)術(shù)期刊,已發(fā)表文章研究領(lǐng)域涵蓋包括COVID-19研究、疾病發(fā)生轉(zhuǎn)移機(jī)制,免疫研究、腦神經(jīng)、白血病、胚胎發(fā)育、糖尿病、退行性疾病和植物領(lǐng)域研究等。十二年測序經(jīng)驗,累計服務(wù)...
基于測序的數(shù)據(jù)能夠?qū)⒄蔑@其強(qiáng)大之處,因為它能夠了解同一單細(xì)胞的多種生物分析指標(biāo)。如果說單細(xì)胞基因表達(dá)提供了一種顏色的詳細(xì)信息,那么單細(xì)胞多組學(xué)提供了同一細(xì)節(jié)的全彩色圖譜,為您帶來樣本的真實視圖。烈冰自2019年引進(jìn)的BD Rhapsody單細(xì)胞平臺以來,能夠從同一單細(xì)胞中讀取細(xì)胞復(fù)雜性的多組學(xué)特征。與傳統(tǒng)方法不同,單細(xì)胞多組學(xué)簡化了您需要開展的實驗,也節(jié)省了您需要分析的樣本,而能獲得相同的結(jié)果。這不但節(jié)省了寶貴的樣本,還保證了更高的生物學(xué)準(zhǔn)確性,因為您不需要匹配拆分樣本的數(shù)據(jù)集并通過計算來推斷各個組學(xué)之間的關(guān)系。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺,助力您的深入科學(xué)探究。南京single ...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗。烈冰實驗室包含從樣本處理到測...
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨(dú)運(yùn)作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運(yùn)作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運(yùn)作至關(guān)重要?!睘榱送苿涌茖W(xué)發(fā)現(xiàn),科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對基因表達(dá)及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進(jìn)行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問題上已證實是行之有效的?;凇办o態(tài)蜂巢”技術(shù),實現(xiàn)落孔細(xì)胞的物力分割和磁珠的一對一匹配。武漢BD Rhapsody單細(xì)胞多組學(xué)測序...
基因和基因產(chǎn)物并不是單獨(dú)運(yùn)作的,而是參與了相互關(guān)聯(lián)的復(fù)雜通路、網(wǎng)絡(luò)和分子系統(tǒng),這些合在一起實現(xiàn)了細(xì)胞、組織和生物體的運(yùn)作。定義這些系統(tǒng)并確定它們的特征和相互作用,對于了解生物系統(tǒng)如何運(yùn)作至關(guān)重要?!睘榱送苿涌茖W(xué)發(fā)現(xiàn),科學(xué)家們需要各種能夠幫助多方位了解其樣本的潛在生物復(fù)雜性的研究工具。對于越來越多的研究人員來說,單細(xì)胞RNA測序和單細(xì)胞多組學(xué)——即在單細(xì)胞分辨率下對基因表達(dá)及其他基于DNA、RNA或蛋白質(zhì)的分析物進(jìn)行定量分析的基因組方法——在幫助解決他們面臨的生物學(xué)問題上已證實是行之有效的。對于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關(guān)注粒細(xì)胞的項目,推薦您使用烈冰BD 單細(xì)胞測序平臺。長沙BD VDJ單細(xì)...
您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),首先,該系統(tǒng)的技術(shù)原理是基于cyto-seq的微孔技術(shù),因此不會因為樣本細(xì)胞體積太大或懸液背景太雜等問題導(dǎo)致捕獲通道的堵塞進(jìn)而導(dǎo)致樣本的損失;其次,BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)無電子元件,便于攜帶,當(dāng)您的樣本需及時實驗時,我們可以“拎包上門”,快速的完成細(xì)胞捕獲部分,不至于珍貴樣本因細(xì)胞活性快速下降帶來的損失;在這,BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)對細(xì)胞數(shù)量包容性較好,細(xì)胞懸液上樣量高達(dá)575ul,針對樣本中細(xì)胞數(shù)量較少的組織類型,也能完成整個項目的細(xì)胞捕獲工作。單細(xì)胞測序是高通量測序下的又一重大技術(shù)突破。...
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個斜率拐點(diǎn)的時候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因...
從單細(xì)胞測序描述性分析轉(zhuǎn)向復(fù)雜樣本中不同細(xì)胞類型的功能解析,越來越需要一種多組學(xué)的細(xì)胞生物學(xué)視角。通過單細(xì)胞多組學(xué)——即對不同組學(xué)的數(shù)據(jù)集進(jìn)行分析和整合——科學(xué)家能夠從同一個單細(xì)胞來源中檢測多種細(xì)胞特征。這些特征包括全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)、細(xì)胞表面蛋白表達(dá)、免疫組庫序列(包括T細(xì)胞和B細(xì)胞受體)以及用于了解表觀基因組調(diào)控的開放染色質(zhì)區(qū)域。隨著單個實驗可提供更多信息豐富的數(shù)據(jù),研究人員的獲益更多,包括保留珍貴樣本、提高生產(chǎn)力、減少因批次效應(yīng)引起的錯誤,并節(jié)省更多的高科技資源(從資助基金到人員時間)。烈冰BD Rahpsody單細(xì)胞測序平臺,助力您的深入科學(xué)探究。廈門scRNA單細(xì)胞服務(wù)機(jī)構(gòu)單細(xì)胞測序技...
所謂的高通量測序技術(shù),又名大規(guī)模平行測序,是將 DNA(或者 cDNA)隨機(jī)片段化、加接頭,制備測序文庫,通過對文庫中數(shù)以萬計的克隆(colony)進(jìn)行延伸反應(yīng),檢測對應(yīng)的信號,獲取序列信息。與傳統(tǒng)測序法(Sanger法等)相比,高通量測序技術(shù)在處理大規(guī)模樣品時具有明顯的優(yōu)勢,又快(兩天)又多(數(shù)百萬克隆),成為目前組學(xué)研究的主要技術(shù)。單細(xì)胞測序是一個系統(tǒng)的工程,開展項目前您可能會先評估它提供的見解是否與您的研究問題相匹配,如果匹配,實驗過程如何規(guī)劃,實驗平臺如何選擇,樣本如何制備,數(shù)據(jù)如何分析等等,而在這一切開始之前,我們的服務(wù)就已經(jīng)開始了,從銷售到實驗到專業(yè)技術(shù)支持,我們開通全線對接渠道,...
烈冰生物BD Rhapsody平臺,采用精簡的工作流程助力您的實驗成功: 1.制備單細(xì)胞懸液:可使用碧迪醫(yī)療單細(xì)胞多樣本分析試劑盒和 /或BD Ab-seq寡核苷酸偶聯(lián)抗體( Ab-Oligos)將細(xì)胞染色 2.微孔板預(yù)充和處理:使用自動移液器進(jìn)行液體交換 3.單細(xì)胞捕獲工作流程: (1)細(xì)胞上樣:上樣 575微升細(xì)胞懸液;系統(tǒng)未采用微流體通道設(shè)計,無需擔(dān)心通道堵寨;通過重力輕輕沉淀細(xì)胞,可捕獲脆弱細(xì)胞,BD Rhapsody微孔板包含大于220,000個分區(qū),可在低雙細(xì)胞率下捕獲多達(dá)40000個細(xì)胞 (2)細(xì)胞上樣掃描:估算捕獲的活細(xì)胞數(shù)量和細(xì)胞多態(tài)率 (3)磁珠上樣:微孔的正六邊形幾何形狀...
Single Cell Sequencing技術(shù),即利用優(yōu)化后的高通量測序技術(shù)(NGS,Next Generation Sequencing)分析每一個單個細(xì)胞的序列信息,從而更高分辨率地揭示細(xì)胞間的細(xì)胞差異以及其在微環(huán)境中的功能情況。那么問題來了,如何獲得單個細(xì)胞?如果無法獲得單個細(xì)胞這一切都是不成立的;如何獲得大批量的單個細(xì)胞?單個組織細(xì)胞群體通常在百萬級別以上,如果被檢測的測序細(xì)胞數(shù)量過小精確度不足;如何低成本地獲得大批量單個細(xì)胞?單細(xì)胞測序成本非常高,尤其是需要測2000~3000個以上的細(xì)胞的時候,如果單個細(xì)胞的分選成本也很高,技術(shù)根本無法普及。所以,正因為這些問題的存在使得高通量測...
單細(xì)胞測序龐大的數(shù)據(jù)烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,可實現(xiàn)零代碼操作、簡單方便:單細(xì)胞瀏覽器的操作簡單,不需要命令行操作。簡單拖拽、設(shè)置參數(shù)即可運(yùn)行,即使生信0基礎(chǔ)用戶也可以運(yùn)用自如;可視化展示海量結(jié)果文件:可視化展示Cluster的基因數(shù),UMI數(shù)量、線粒體RNA占比信息;以及不同Cluster對應(yīng)的細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、RNA表達(dá)量、樣本細(xì)胞分布、線粒體RNA表達(dá)量等;3D立體展示,文章動圖先人一步:單細(xì)胞瀏覽器針對t-SNE圖、UMAP圖和pseudotime結(jié)果進(jìn)行三維立體展示,更加直觀立體的觀察細(xì)胞分布和聚類情況。個性化制定測序項目方面,滿足從檢測基因...
您的珍貴樣本,可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),基于BD平臺從原理到效率到通量的多重包容性,使得BD平臺對實驗過程存在的批次效應(yīng)產(chǎn)生的可能性更小,可在技術(shù)、生物學(xué)、實驗中心和用戶之間的樣本檢測獲得一致、可靠的結(jié)果,而磁珠的拆分使用和即時存儲,可增加實驗設(shè)計的靈活性,配套的BD Scanner可視化工作流程質(zhì)控,從細(xì)胞鋪板前微孔板空板檢測,到細(xì)胞上樣、磁珠上樣、磁珠洗滌掃描、細(xì)胞裂解、磁珠回收、回收磁珠掃描等全過程,均實現(xiàn)BD Scanner的可視化質(zhì)控,讓您的每個樣本在實驗端全程無憂。烈冰斥巨資引進(jìn)Novaseq6000,開啟更大通量測序新紀(jì)元。合肥BD單細(xì)胞測序服務(wù)基...
針對BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲平臺,烈冰生物提供專業(yè)的優(yōu)化試劑和專業(yè)知識:BD Rhapsody試劑是轉(zhuǎn)為 Rhapsody 系統(tǒng)設(shè)計,旦性能已得到驗證的產(chǎn)品,因此研究人員可以專注于解決生物學(xué)問題,而不必花費(fèi)時間應(yīng)對多組學(xué)分析的技術(shù)障礙。此外,我們還提基于BD平臺的單細(xì)胞多組學(xué)服務(wù),如Ab-Seq檢測試劑盒使用的抗體已在流式細(xì)胞分析中得到充分研究,這使得研究人員能夠建立真值并迅速加深對生物學(xué)系統(tǒng)的理解。作為BD中國單細(xì)胞聯(lián)合實驗室的合作伙伴,我們將繼續(xù)擴(kuò)展檢測試劑盒和試劑產(chǎn)品組合的范圍,以支持前沿多組學(xué)分析。我們經(jīng)驗豐富的專業(yè)客戶服務(wù)團(tuán)隊可在多組學(xué)分析的各個方面為您提供幫助。烈冰實驗室包...
關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒灅颖局苽洌@與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生...
烈冰生物在上海、北京、廣州、西安、江西等多地部署單細(xì)胞測序?qū)嶒灲M中心,多地部署搭建BD Rhapsody單細(xì)胞實驗平臺,基于微孔的強(qiáng)大的高通量單細(xì)胞分析系統(tǒng),為您提供可靠的單細(xì)胞分析工作流程,該系統(tǒng)可通過簡單的唯恐把工作流程和多重條碼標(biāo)記系統(tǒng),對高通量單細(xì)胞進(jìn)行多組學(xué)的信息捕獲,由此捕獲的信息科進(jìn)一步生成各種類型的二代測序(NGS)文庫。之后對文庫進(jìn)行測序和基于NovelBrain生物大數(shù)據(jù)分析平臺(云平臺)的數(shù)據(jù)可視化分析,實現(xiàn)高位分辨率下的組織內(nèi)基因的表達(dá)差異和表達(dá)豐度。單細(xì)胞測序技術(shù)的迅速發(fā)展和應(yīng)用推廣,為從多維度揭示疾病發(fā)展提供了強(qiáng)有力的工具。長沙BD單細(xì)胞測序公司烈冰生物BD Rha...
關(guān)于BD Rhapsody單細(xì)胞平臺的樣本類型和樣本制備 :在上機(jī)前需要注意細(xì)胞消化后的細(xì)胞團(tuán)塊,獲得分離良好的細(xì)胞懸液、且細(xì)胞活力高(>70%);此外,了解您所研究細(xì)胞的大小范圍也很重要。細(xì)胞大小通常與細(xì)胞表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本數(shù)量有關(guān)。各種尺寸不同的細(xì)胞(一般直徑不大于50μm)均可與我們基因表達(dá)解決方案中使用的BD Rhapsody平臺兼容。一般來說,細(xì)胞制備方案將根據(jù)組織來源和細(xì)胞類型而變化。每種組織類型都是獨(dú)特的,因此,必須在開始任何單細(xì)胞實驗之前優(yōu)化樣本制備,烈冰多年樣本解離消化經(jīng)驗,累積10+物種、50+組織的消化protocol,若您的樣本為組織,且尚未成功將組織樣本消化成單細(xì)胞懸液,烈...
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞數(shù)量判斷環(huán)節(jié):主要是對細(xì)胞數(shù)量、基因表達(dá)量、測序質(zhì)量進(jìn)行整體描述。過濾標(biāo)準(zhǔn):由于細(xì)胞破碎后游離RNA會釋放到環(huán)境或孔中,并且測序中也會存在一些死細(xì)胞,導(dǎo)致數(shù)據(jù)存在background值。因此,我們需要設(shè)定一定的標(biāo)準(zhǔn)來過濾掉假細(xì)胞或死細(xì)胞。以10× Genomics為例,細(xì)胞數(shù)量判斷主要通過分析UMI Counts-Barcode曲線斜率拐點(diǎn),當(dāng)存在多個斜率拐點(diǎn)的時候,結(jié)合預(yù)期UMI=500時的細(xì)胞數(shù)量進(jìn)行過濾。當(dāng)斜率拐點(diǎn)低于UMI=500的時候,選擇UMI=500作為細(xì)胞的判斷的標(biāo)準(zhǔn);否則,選擇和預(yù)期細(xì)胞數(shù)量接近的拐點(diǎn)作為細(xì)胞判斷的位置。這樣我們能夠有效獲得真實的并且在基因...
機(jī)體為響應(yīng)各種應(yīng)激,其細(xì)胞會從一種功能“狀態(tài)”轉(zhuǎn)變?yōu)榱硪环N功能“狀態(tài)”;當(dāng)細(xì)胞在不同狀態(tài)之間轉(zhuǎn)變時,往往會經(jīng)歷轉(zhuǎn)錄重組,導(dǎo)致一些基因被沉默,一些基因被重新“喚醒”,但純化這些瞬態(tài)細(xì)胞進(jìn)行研究是很困難或不可能的;scRNA-seq擬時序分析可以讓我們在不需要純化的情況下查看這些細(xì)胞狀態(tài)。擬時序分析,即根據(jù)不同細(xì)胞亞群基因表達(dá)量隨時間的變化情況,構(gòu)建細(xì)胞譜系發(fā)育,但這里的時間并不是真時間,而是一個虛擬的時間,是指的細(xì)胞與細(xì)胞之間的轉(zhuǎn)化和演替的順序和軌跡。即使在同一個樣本中,也會存在多種不同的細(xì)胞形態(tài)。因此,不論測定了多少樣本,我們都可以采用擬時序分析對樣本中的細(xì)胞轉(zhuǎn)化和變化進(jìn)行描述。全線搭建BD ...
烈冰科技于2010年誕生之初便立足于高通量測序行業(yè),為科研學(xué)者提供專注的測序數(shù)據(jù)分析服務(wù),先后經(jīng)歷基因芯片時代、基因測序、轉(zhuǎn)錄組測序時代...在科技日新月異的洪流中始終獨(dú)占鰲頭。2018年以來,單細(xì)胞測序進(jìn)入發(fā)展的快車道,烈冰作為國內(nèi)首批引進(jìn)單細(xì)胞實驗雙平臺的公司,依托自主研發(fā)的NovelBrain?生物大數(shù)據(jù)分析平臺,為用戶提供一站式全流程的單細(xì)胞測序服務(wù)和解決方案。4年的單細(xì)胞技術(shù)的積累,烈冰已具備大鼠、小鼠、斑馬魚、猴、裸鼴鼠、水稻、擬南芥等10+物種,皮膚、腦、脂肪、心臟、花序等50+組織類型,100+細(xì)胞類型,1000+靶標(biāo)基因,10000+樣本處理經(jīng)驗。烈冰生物為您提供多平臺一站式...
關(guān)于單細(xì)胞測序?qū)嶒灅颖局苽?,這與流式細(xì)胞術(shù)用戶熟悉的步驟完全一致,也就是通過酶促或機(jī)械消化、細(xì)胞分選或其他細(xì)胞分離技術(shù)從整個樣本中制備生成活的單細(xì)胞懸液。隨后是細(xì)胞計數(shù)和質(zhì)量控制步驟,以確保您的樣本有適當(dāng)濃度的活細(xì)胞,并且不含細(xì)胞團(tuán)塊和死細(xì)胞碎片。如有必要,您還可以使用抗體對樣本進(jìn)行染色,標(biāo)記細(xì)胞表面蛋白或其他生物分析物,或者通過FACS來富集感興趣的細(xì)胞類型。解離樣本時采取的具體步驟將根據(jù)您的起始材料和實驗?zāi)繕?biāo)而定。也許需要額外的制備步驟,具體取決于組織質(zhì)量、樣本豐度、細(xì)胞大小,以及是否需要提取出細(xì)胞核進(jìn)行染色質(zhì)可接近性分析。無論具體的考慮因素如何,所有樣本類型都遵循同一個基本原則,那就是生...
烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞分析系統(tǒng),可平行分析成千上萬個單細(xì)胞內(nèi)數(shù)千個基因的表達(dá)水平,單細(xì)胞RNA-seq正在改變我們對細(xì)胞的理解。而烈冰作為多平臺的技術(shù)服務(wù)提供商,基于BD 在生物學(xué)領(lǐng)域40年的專業(yè)技術(shù),滿足您的實驗需求,在單細(xì)胞水平理解細(xì)胞形態(tài)和功能。BD單細(xì)胞測序分析系統(tǒng)克服了傳統(tǒng)檢測的局限性,如微陣列和大量細(xì)胞RNA-seq,這些技術(shù)檢測通過實現(xiàn)對各個細(xì)胞之間的微妙差異的觀察,依賴于對多個細(xì)胞的平行檢測。用戶可以鑒定和表征新型和罕見細(xì)胞類型,其進(jìn)一步幫助理解從免疫學(xué)到疾病發(fā)展的多個領(lǐng)域內(nèi)的生物學(xué)過程。單細(xì)胞測序因其強(qiáng)大的探究疾病--細(xì)胞--基因的關(guān)系,一度成為高通量測序技術(shù)的...
相對于Smart-Seq技術(shù)在細(xì)胞數(shù)量上的問題,BD平臺普遍提供的細(xì)胞數(shù)量都在1000-10000不等的測序細(xì)胞量,特殊研究需求的項目,可提供上限40000個細(xì)胞的捕獲量(單個樣本)。這個量級的測序細(xì)胞量已經(jīng)可以說能夠完全覆蓋絕大部分組織的Single Cell群體類型。因此,對于基于基因表達(dá)進(jìn)行準(zhǔn)確細(xì)胞分型上,無論是從細(xì)胞數(shù)量上來說還是表達(dá)檢測可靠性來說,都會更實用。此外針對特殊項目研究,如需要捕獲和分析脆弱的細(xì)胞,如粒細(xì)胞、中性粒細(xì)胞、CAR-T細(xì)胞、干細(xì)胞、移植瘤細(xì)胞、骨髓瘤細(xì)胞等,烈冰生BD平臺也有更好的捕獲效能,滿足您的實際需求。對于消化背景雜,樣本初始數(shù)量少,關(guān)注粒細(xì)胞的項目,推薦...
烈冰生信團(tuán)隊傾情研發(fā)的NovelBrain?生信大數(shù)據(jù)分析平臺,針對龐大的單細(xì)胞測序數(shù)據(jù),能夠?qū)崿F(xiàn)細(xì)胞類型鑒定的快、精、準(zhǔn):一鍵導(dǎo)入gene list構(gòu)建個性化基因列表;輕松一點(diǎn)即可展示Marker基因的Feature plot;任意修改Cluster的顏色和名稱助力高效鑒定細(xì)胞類型;一鍵獲得t-SNE圖、Heatmap和Violin圖:輕松獲得并下載基因表達(dá)的t-SNE圖、Heatmap、Violin圖,還可以通過調(diào)節(jié)寬、高和系數(shù)比例來調(diào)節(jié)美觀。平臺上線300+task自主分析工具、50+pipeline工作流模板,幫助烈冰生信分析團(tuán)隊和自主分析用戶實現(xiàn)分析工具和模板的快速調(diào)用和一站式全流程...
針對單細(xì)胞測序的細(xì)胞上樣數(shù),為什么不建議捕獲到的細(xì)胞數(shù)量越高越好?一味地追求高數(shù)量的細(xì)胞捕獲可能會存在一些問題。例如在上機(jī)細(xì)胞懸液濃度固定時,如果目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)增加到8000甚至10000,上樣細(xì)胞懸液體積勢必增加,在細(xì)胞懸液質(zhì)量不是很理想(細(xì)胞活性5%、結(jié)團(tuán)率均>5%)的情況下,引入的背景信號會增加,分析結(jié)果不理想的直接體現(xiàn)包括:cell、non-cell無法有效區(qū)分和Fraction reads in cells偏低。當(dāng)cell和non-cell無法有效區(qū)分時,會使得數(shù)據(jù)出現(xiàn)假陽性和假陰性結(jié)果!當(dāng)目標(biāo)細(xì)胞捕獲數(shù)很大時,多細(xì)胞率會增加,數(shù)據(jù)分析時,此部分“cell”表現(xiàn)為基因檢測數(shù)和UMI檢...
烈冰生物成立于2010年,與時俱進(jìn),堅持為科研學(xué)者提供國際前沿的高通量測序?qū)嶒灪蜕疃鹊纳镄畔?shù)據(jù)分析服務(wù),已逐步發(fā)展為單細(xì)胞多組學(xué)檢測服務(wù)****。專注于“單細(xì)胞測序系列技術(shù)服務(wù)”的專精領(lǐng)域,在上海、北京、廣州、西安和江西等地?fù)碛袛?shù)千平辦公場所,并布局多中心產(chǎn)品研發(fā)生產(chǎn)基地和營銷、運(yùn)營中心。2016年起連續(xù)被評為上海市****,60+項自主知識產(chǎn)權(quán),轉(zhuǎn)化率近80%。產(chǎn)品覆蓋從單細(xì)胞測序,核測序,單細(xì)胞多組學(xué),空間轉(zhuǎn)錄組測序等多組學(xué)聯(lián)合的實驗+數(shù)據(jù)分析全流程服務(wù)平臺。為600+國內(nèi)高校和醫(yī)院、5000+深度合作學(xué)者用戶、10000+生命科學(xué)探索的重要科研項目在醫(yī)藥開發(fā)、科學(xué)研究、醫(yī)學(xué)及...
您的珍貴樣本,還可以放心依賴烈冰生物BD Rhapsody單細(xì)胞捕獲系統(tǒng),BD RhapsodyTM單細(xì)胞捕獲系統(tǒng)采用微孔技術(shù),對細(xì)胞的捕獲沒有偏好性,實現(xiàn)高達(dá)80%的微孔板捕獲率,由于單個微孔板中容納了22萬+個微孔,而現(xiàn)階段單細(xì)胞測序?qū)嶒灱夹g(shù)通常要求單個樣本捕獲3000-5000,至高達(dá)10000個細(xì)胞,即可滿足科研探索需求,因此這種“泊松分布”的原理類似于上樣細(xì)胞的無限稀釋過程,但22萬+微孔的存在,也對大體量細(xì)胞數(shù)目的科學(xué)研究有很好的包容性,細(xì)胞通量分為可擴(kuò)展至100-40000個細(xì)胞的捕獲(單個微孔板),滿足您的多重需求。高通量測序技術(shù)是對傳統(tǒng)測序一次突破性的改變,一次對幾十萬到幾百...